داستان این فیلم درباره ی پدربزرگی هفتاد ساله است که با نوه ی کوچک خود زندگی می کند. او متوجه می شود که زمان کمی برای زندگی دارد و تصمیم می گیرد تا برای آینده شان آماده شود و …

«صبح بخیر آقای رئیس‌جمهور» روایتی کوتاه از سیاست و زندگی سه رئیس‌جمهور مختلف است: رئیس‌جمهور پیر، کیم جونگ‌هو در پایان دوره‌اش؛ رئیس‌جمهور جوان، چا جی‌وو که در سیاست خارجی مهارت دارد و بسیار مصمم است؛ و یک رئیس‌جمهور زن به نام هان کیونگ‌جا. آن‌ها بر سر انتخاب‌هایی که باید بین سیاست و اخلاق انجام دهند، مستأصل هستند. رنج کیم جونگ‌هو که در قرعه‌کشی برنده می‌شود، عذاب چا جی‌وو که عضوی از بدنش را اهدا می‌کند و مشکلات هان کیونگ‌جا که با بحران طلاق روبروست.

سو-هو یک پسر دبیرستانی ساده است و سو-اون دختری باهوش و زیبا در همان مدرسه است. به دلیلی نامشخص، سو-اون به این پسر علاقه‌مند می‌شود و به دلایلی به همان اندازه مرموز، سو-هو را در دریا نجات می‌دهد، هرچند پسر نمی‌داند چه کسی واقعاً او را نجات داده است.

هو، یک فروشنده دوره‌گرد بازار، در جوانی عشق کوتاه و پرشوری با دختری به نام بون داشت و هنوز هم آن خاطره را در قلب خود گرامی می‌دارد. یک روز، او به طور اتفاقی با فروشنده جوان بازار ملاقات می‌کند که مانند خودش چپ‌دست است. در حین گفتگو با او، متوجه می‌شود که این مرد در واقع پسر اوست.

مشخص می‌شود که زمین‌لرزه‌ها در مرکز کره کار یونگاری است؛ یک خزنده ماقبل تاریخ و بنزین‌خوار که به زودی شروع به ویرانگری در سئول می‌کند.